Бухгалтерська служба утворена й діє як самостійний структурний підрозділ Університету, що підпорядковується, є підзвітним та підконтрольним безпосередньо ректору Університету.

У своїй діяльності бухгалтерська служба керується Конституцією України, законами України «Про освіту», «Про вищу освіту», актами Президента України та Кабінету Міністрів України, іншими нормативно-правовими актами України, що регламентують бюджеті відносини й фінансово-господарську діяльність бюджетної установи, а також Статутом, Правилами внутрішнього розпорядку, Колективним договором, наказами (розпорядженнями) ректора та іншими локальними нормативними актами Університету.